RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PPIAL4EA0A075B759 164 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PPIAL4DF5H284 164 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN15O95858 294 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 DNLZQ5SXM8 178 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 NRGNQ92686 78 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF665Q9H7R5 613 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 C7orf66A4D0T2 115 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 K7N7A8 449 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 M0R2Z0 102 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CLDN1O95832 211 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TK1P04183 234 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 COL8A2P25067 703 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GAGE5Q13069 117 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GAGE6Q13070 117 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CD276Q5ZPR3 534 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LINC01551Q86U37 167 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CCL13Q99616 98 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF785A8K8V0 405 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 MGST3O14880 152 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 IL5P05113 134 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GLIPR1P48060 266 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 HMGN3Q15651 99 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 AP1S3Q96PC3 154 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LIME1Q9H400 295 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 THYN1Q9P016 225 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 FBXL17Q9UF56 701 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PSG8Q9UQ74 426 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 LYNX1P0DP58 116 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 FCGR2CP31995 323 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ECI1P42126 302 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 AMTP48728 403 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 RANP62826 216 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZVH6 145 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 OR4A16Q8NH70 328 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GPR132Q9UNW8 380 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 K7EN84 100 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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CCR6-201ENST00000341935 PGAM2P15259 253 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CXCL3P19876 107 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 PAFAH1B2P68402 229 aa5.01□□□□□ -1.61
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CCR6-201ENST00000341935 EDDM3AQ14507 147 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ZNF787Q6DD87 383 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TMUB2Q71RG4 321 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 NECAP1Q8NC96 275 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 GALNT14Q96FL9 552 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 KIRREL1Q96J84 757 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 BET1LQ9NYM9 111 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 CLN8Q9UBY8 286 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5□□□□□ -1.61
CCR6-201ENST00000341935 HPRT1P00492 218 aa5□□□□□ -1.61
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