RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 TOR2AQ5JU69 321 aa15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 OR5B3Q8NH48 314 aa15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 HINT2Q9BX68 163 aa15.48■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 TNCP24821 2201 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 SPG11Q96JI7 2443 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 ODF3BA8MYP8 253 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 UMAD1C9J7I0 102 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 NDUFS8O00217 210 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 OR8U8P0C7N1 319 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 FHITP49789 147 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 PRCDQ00LT1 54 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 MED13LQ71F56 2210 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 TRIM77I1YAP6 450 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 RRHO14718 337 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 CAMLGP49069 296 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 CLEC2AQ6UVW9 174 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 C10orf105Q8TEF2 133 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 TMEM147Q9BVK8 224 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 SIRPDQ9H106 197 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.47■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 VPS13CQ709C8 3753 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PPI3 338 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 SLC25A17O43808 307 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 FOXH1O75593 365 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 CEACAM3P40198 252 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 BTNL8Q6UX41 500 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 RSG1Q9BU20 258 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.46■□□□□ 0.07
UPP1-201ENST00000331803 CHD6Q8TD26 2715 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 NUDT19A8MXV4 375 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 F2RL1P55085 397 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 NRGNQ92686 78 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 FBXO7Q9Y3I1 522 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 RAB19A4D1S5 217 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 VWC2LB2RUY7 222 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 RAB11AP62491 216 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 ZNF616Q08AN1 781 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 VWC2Q2TAL6 325 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 LYPD6BQ8NI32 183 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 PERPQ96FX8 193 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.45■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PRD5 423 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PRF3 423 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PRM7 423 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TOX4O94842 621 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 FAM213BQ8TBF2 198 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa15.44■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 FAM157AC9JC47 383 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TIMM23O14925 209 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 IFNA4P05014 189 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 NPY1RP25929 384 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TEX45Q8NA69 505 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 WNK2Q9Y3S1 2297 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 CA2P00918 260 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 CNTFRP26992 372 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 GGACTQ9BVM4 153 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 LPAR2Q9HBW0 351 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.43■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 PRSS46E5RG02 174 aa15.42■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 E7EUB6 86 aa15.42■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 PSG5Q15238 335 aa15.42■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 UQCC3Q6UW78 93 aa15.42■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 OR10W1Q8NGF6 305 aa15.42■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 RNF5Q99942 180 aa15.42■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TSPAN15O95858 294 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 CRYGBP07316 175 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 PAX1P15863 534 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 CD1BP29016 333 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 SERF2P84101 59 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms