RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325805.12

BBX-201, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BBX, Length 3,517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-201ENST00000325805 TET1Q8NFU7 2136 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 ZIC3O60481 467 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 PITX3O75364 302 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 UPK3AO75631 287 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 CD27P26842 260 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 ANKRD37Q7Z713 158 aa4.9□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 PTH2Q96A98 100 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 PRELID3AQ96N28 172 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 FOXQ1Q9C009 403 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 SPTA1P02549 2419 aa4.9□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.89□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 A0A0G2JNG1 304 aa4.89□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 H3BMH7 237 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 FSTP19883 344 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 ERG28Q9UKR5 140 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 A0A1W2PQM1 296 aa4.89□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 IGLV3-25P01717 112 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 CLRN1P58418 232 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 SLC48A1Q6P1K1 146 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.89□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 GDF1P27539 372 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.89□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.88□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.88□□□□□ -1.63
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BBX-201ENST00000325805 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 POLEQ07864 2286 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 HS3ST1O14792 307 aa4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
BBX-201ENST00000325805 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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