RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 OOSP1A8MZH6 123 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 RAB11AP62491 216 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 CITED4Q96RK1 184 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-201ENST00000319942 SPG11Q96JI7 2443 aa8.15□□□□□ -1.1
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