RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 OR8B2Q96RD0 313 aa8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CBY3A6NI87 242 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CD24P25063 80 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ODF1Q14990 250 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TNFRSF14Q92956 283 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HINT2Q9BX68 163 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CHODLQ9H9P2 273 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GU03 582 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GV50 99 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV4-39P01824 125 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RNF151Q2KHN1 245 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 IL22RA2Q969J5 263 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RBKSQ9H477 322 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 MMP26Q9NRE1 261 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 J3QR06 171 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SYNGR2O43760 224 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 DYNLT3P51808 116 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ARL16Q0P5N6 197 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 IFNA17P01571 189 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR8U8P0C7N1 319 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 FHITP49789 147 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RAB7AP51149 207 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2KP61086 200 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PKIAP61925 76 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 RUNX1Q01196 453 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 GAMTQ14353 236 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 BAP18Q8IXM2 172 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 DDB2Q92466 427 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PERPQ96FX8 193 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 J3KRW8 73 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 GUCA2BQ16661 112 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 MIDNQ504T8 468 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM140Q9NV12 185 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PSENENQ9NZ42 101 aa8.93□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 GPR137BO60478 399 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 APELAP0DMC3 54 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 P2RY1P47900 373 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 EFNA4P52798 201 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SVBPQ8N300 66 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CCL19Q99731 98 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP10-9P60411 292 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 Q8N7P7 452 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.92□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 TCF21O43680 179 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HPRT1P00492 218 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 P0C879 139 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 AKR1C1Q04828 323 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR4A47Q6IF82 309 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 CNTFRP26992 372 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 OR4A16Q8NH70 328 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.91□□□□□ -0.98
GGPS1-201ENST00000282841 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms