RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 PSPNO60542 156 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.66□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ARID1AO14497 2285 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MSMBP08118 114 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 COL8A1P27658 744 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ZNF137PP52743 207 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 KISS1Q15726 138 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CKAP5Q14008 2032 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 CRPP02741 224 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PRB1P04280 392 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PMELP40967 661 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 PSG5Q15238 335 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 Q5BKY6 102 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 TECTAO75443 2155 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 NINQ8N4C6 2090 aa6.65□□□□□ -1.34
USP3-201ENST00000268049 UPK3AO75631 287 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OTPQ5XKR4 325 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RNF122Q9H9V4 155 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GPR27Q9NS67 375 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LDLRAD4O15165 306 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CXorf1O96002 111 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.65□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TRDCB7Z8K6 153 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TEX38Q6PEX7 206 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PDPNQ86YL7 162 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SFRP2Q96HF1 295 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C18orf12Q96KH6 178 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TSC2P49815 1807 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SRIP30626 198 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 NOTCH4Q99466 2003 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PRS3 328 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OOSP1A8MZH6 123 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C4orf51C9J302 202 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FGF12P61328 243 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RND3P61587 244 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 SERF2P84101 59 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 LCN12Q6JVE5 192 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CEP250Q9BV73 2442 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 AMY1AP04745 511 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 APOC4P55056 127 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CLDN18P56856 261 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MESTQ5EB52 335 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 C5orf30Q96GV9 206 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DKK4Q9UBT3 224 aa6.64□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 A0A087WV48 116 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 H3BUT2 72 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OGG1O15527 345 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 UMODP07911 640 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CECR9P0C854 216 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CTLA4P16410 223 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZAR1Q86SH2 424 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 MOSP00540 346 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 FXYD3Q14802 87 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 GALNT14Q96FL9 552 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 TMEM262E9PQX1 116 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 HLA-DQB1P01920 261 aa6.63□□□□□ -1.35
USP3-201ENST00000268049 BGLAPP02818 100 aa6.63□□□□□ -1.35
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