RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 TEX38Q6PEX7 206 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 GFI1Q99684 422 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 PILRAQ9UKJ1 303 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 ZNF146Q15072 292 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 MDP1Q86V88 176 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 COX5BP10606 129 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 EGR4Q05215 589 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 FOXL1Q12952 345 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 PCSK4Q6UW60 755 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 OCC1Q8TAD7 63 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-201ENST00000256413 MPV17P39210 176 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CX3CL1P78423 397 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 MPV17L2Q567V2 206 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 A0A0J9YW62 118 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 TMEM95Q3KNT9 176 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PAX2Q02962 417 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CST9LQ9H4G1 147 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PSG9Q00887 426 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 GUSBP11Q6P575 273 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 DNAL4O96015 105 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 RP1P56715 2156 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 A8MWV9 139 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 COL9A1P20849 921 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 GAGE1Q13065 139 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ORMDL3Q8N138 153 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 OR4A5Q8NH83 315 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PRR7Q8TB68 274 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NPIPB3Q92617 1050 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GWJ7 208 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 FAM181BA6NEQ2 426 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ZNF441Q8N8Z8 693 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 IGFBP2P18065 325 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 SFTA2Q6UW10 78 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 C1RLQ9NZP8 487 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PQM1 296 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ZNF585BQ52M93 769 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 SPINK14Q6IE38 97 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ITGB4P16144 1822 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 HAX1O00165 279 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 SSPNQ14714 243 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 Q6AWC8 147 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ID3Q02535 119 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 HTN1P15515 57 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 MC5RP33032 325 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 GPR82Q96P67 336 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 JPT1Q9UK76 154 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 GREM1O60565 184 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 C3orf79P0CE67 100 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 C3AR1Q16581 482 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 FBXW9Q5XUX1 488 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.61□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 LINC01565O15544 149 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 TIMP3P35625 211 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 FMC1Q96HJ9 113 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 VSIRQ9H7M9 311 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PROB1E7EW31 1015 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 C19orf54Q5BKX5 351 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 ASCL5Q7RTU5 278 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CD5LO43866 347 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 KIR2DL4Q99706 377 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 NDUFA3O95167 84 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 CACNG7P62955 275 aa13.6□□□□□ -0.23
CTIF-201ENST00000256413 PRDM14Q9GZV8 571 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms