RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R60P59551 318 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOVQ96L33 236 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 GAB2Q9UQC2 676 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 VSTM5A8MXK1 200 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 GGCTO75223 188 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 GZMBP10144 247 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF718Q3SXZ3 478 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 DRAM1Q8N682 238 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF488Q96MN9 340 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 F8P00451 2351 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 CD99P14209 185 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN2P80188 198 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNIP4Q6PIL6 250 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 PARLQ9H300 379 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 XKRY2A2RUG3 117 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-13P01766 116 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF645Q8N7E2 425 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRA1O75019 489 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 GCH1P30793 250 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB4BP61018 213 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM249Q2WGJ8 235 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 Q5PR19 223 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10G9Q8NGN4 311 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10G7Q8NGN6 311 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNLRB1Q9NP97 96 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf112F2Z3M2 114 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D1BO14796 132 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 P0C879 139 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK11-1P61568 191 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF146Q15072 292 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 VWC2Q2TAL6 325 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTL10Q5JWF8 245 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T10Q8NGZ9 312 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM18Q96B42 140 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 IMMP2LQ96T52 175 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 MSL2Q9HCI7 577 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNIP1Q9NZI2 227 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MWP6 167 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2H2O95918 312 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-33P01593 117 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-33P01594 117 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 FOSL1P15407 271 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CATR1Q13166 79 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF66Q6ZN08 573 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF709Q8N972 641 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10P1Q8NGE3 313 aa21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 Q3ZCU0 254 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8G2PQ6IF36 304 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSM6Q6P461 480 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 MEGF10Q96KG7 1140 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC30A6NM36 301 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PPOXP50336 477 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRNQ5BIV9 151 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 MED13LQ71F56 2210 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CA6P23280 308 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZR03 302 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4F5Q8NH21 305 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4F4Q96R69 305 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 DIRC2Q96SL1 478 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF3Q9BU61 184 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PRO1933Q9H354 126 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SVEP1Q4LDE5 3571 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 LYNX1G3V0Z9 82 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE6DO43924 150 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 RHBDL1O75783 438 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 GYPAP02724 150 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 LYNX1P0DP58 116 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 RAC2P15153 192 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOVP59797 346 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C3Q9NZP0 311 aa21.67■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CD55P08174 381 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 FFAR4Q5NUL3 377 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC17Q9BRA2 123 aa21.66■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PMS2P5A8MQ11 134 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRPB1O00241 398 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB29O14966 203 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 GZMHP20718 246 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 GNB2P62879 340 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 Q96MF0 132 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A22Q9H936 323 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CHODLQ9H9P2 273 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GV90 55 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRY3O43610 288 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBG1P23258 451 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL8P80075 99 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf174Q8IYL3 243 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 GALMQ96C23 342 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 PCGF1Q9BSM1 259 aa21.65■■□□□ 1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf100A8MU93 164 aa21.64■■□□□ 1.05
CAPNS1-201ENST00000246533 KITLGP21583 273 aa21.64■■□□□ 1.05
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