RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	C22orf42	Q6IC83	251 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC140	Q96MF4	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	MLX	Q9UH92	298 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	RAB6A	P20340	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TM4SF20	Q53R12	229 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	OR2A7	Q96R45	310 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM235	A6NFC5	223 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	KBTBD11	O94819	623 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	LY6G6C	O95867	125 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	BTNL8	Q6UX41	500 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	LGALS9	O00182	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	SSX5	O60225	188 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	DIRAS3	O95661	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC3B	P05452	202 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	DEFA4	P12838	97 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	RPA2	P15927	270 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CD36	P16671	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	PSMB6	P28072	239 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	RANBP1	P43487	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078		Q6ZS49	121 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	DTYMK	P23919	212 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	GNG2	P59768	71 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TCF4-262	ENST00000628078	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0J9YWU9	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CTRB1	P17538	263 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	GPR183	P32249	361 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SULT1C2	O00338	296 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	CRYGC	P07315	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-G	P17693	338 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	FCGR2C	P31995	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TCF4-262	ENST00000628078	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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