RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CD1BP29016 333 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS7P47929 136 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 PAX9P55771 341 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 OPCMLQ14982 345 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF429Q86V71 674 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB40CQ96S21 281 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 CR1P17927 2039 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 C15orf61A6NNL5 157 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 UPK2O00526 184 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL12P30050 165 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 SAA4P35542 130 aa20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PIP4P2Q8N4L2 257 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-215ENST00000628018 RBKSQ9H477 322 aa20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 PAX6P26367 422 aa20.02■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 VAMP2P63027 116 aa20.02■□□□□ 0.79
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CAPNS1-215ENST00000628018 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-69P01742 117 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP11Q9NYL4 201 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PSENENQ9NZ42 101 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TCF19Q9Y242 345 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51B2Q9Y5P1 312 aa19.97■□□□□ 0.79
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CAPNS1-215ENST00000628018 CEBPZOSA8MTT3 80 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MOSP00540 346 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 EBI3Q14213 229 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SPINK9Q5DT21 86 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A31Q9H0C2 315 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP50Q9UKX7 468 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF2P09038 288 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOD1P15172 320 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL8P62917 257 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
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