RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSM6Q6P461 480 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 LRP11Q86VZ4 500 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 CORO2AQ92828 525 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 VSIRQ9H7M9 311 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A22Q9H936 323 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM140Q9NV12 185 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 ARID1AO14497 2285 aa7.61□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf61A6NNL5 157 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf62A8K5M9 175 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 F6UZH7 168 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE6DO43924 150 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV1-46P01743 117 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TFF1P04155 84 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 OR9G9P0C7N8 305 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 CD1BP29016 333 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 OPRK1P41145 380 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RND2P52198 227 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 LOXL3P58215 753 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TFF3Q07654 80 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB31Q13636 194 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 ELOBQ15370 118 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 NANPQ8TBE9 248 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB1CQ92928 201 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 BTF3L4Q96K17 158 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5B12Q96R08 314 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 PRNDQ9UKY0 176 aa7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PPV4 95 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MXE2 369 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FNDC10F2Z333 226 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf97H3BN30 126 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 WISP2O76076 250 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 VENTXO95231 258 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 MT-CO2P00403 227 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV2-5P01817 119 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 CD55P08174 381 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FBP1P09467 338 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TMPRSS3P57727 454 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RBPJQ06330 500 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 POU2AF1Q16633 256 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX7Q7RTT5 188 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4F5Q8NH21 305 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8WTZ3 238 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 DDB2Q92466 427 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB24Q969Q5 203 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM210BQ96KR6 192 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 GAFA1Q96PS6 74 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4F4Q96R69 305 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 GCM1Q9NP62 436 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 NGBQ9NPG2 151 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 KNTC1P50748 2209 aa7.59□□□□□ -1.19
EFTUD2-222ENST00000592408 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRBP23467 1997 aa7.59□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP250Q9BV73 2442 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 APOA2P02652 100 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CGB3P0DN86 165 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CGB7P0DN87 165 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP5P22003 454 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 NPY1RP25929 384 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 S100A2P29034 98 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 HNF4GQ14541 408 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms