RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 C16orf95Q9H693 158 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 Q9HAA7 133 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF25Q9UIL4 384 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF221Q9UK13 617 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 CUBNO60494 3623 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM74A7A6NL05 159 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 VGLL3A8MV65 326 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BUX3 64 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 ORC5O43913 435 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 CA11O75493 328 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 MGMTP16455 207 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 NFYBP25208 207 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 HTR2CP28335 458 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 CD34P28906 385 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 BRS3P32247 399 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 KIR2DS4P43632 304 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB13P51153 203 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 DYNLT3P51808 116 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 PLP1P60201 277 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 GABARAPL2P60520 117 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM189A2Q15884 450 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 LY6EQ16553 131 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 OR9G1Q8NH87 305 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01006Q8NI28 216 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 NDNFQ8TB73 568 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 NEK7Q8TDX7 302 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 CST11Q9H112 138 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 BANF2Q9H503 90 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-216ENST00000590105 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 PDCD5O14737 125 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 CLPXO76031 633 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 IGLV1-47P01700 117 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 PSG1P11464 419 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 CEACAM3P40198 252 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM104Q8NE00 496 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ARL11Q969Q4 196 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 CALYQ9NYX4 217 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 PSG11Q9UQ72 335 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 COX11Q9Y6N1 276 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 V9GY05 133 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 A6NDX4 124 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 OOSP1A8MZH6 123 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 LY6LH3BQJ8 138 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC22A1O15245 554 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 PAX6P26367 422 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 GLP1RP43220 463 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ARHGDIBP52566 201 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB11AP62491 216 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 QRFPP83859 136 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 FABP5Q01469 135 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB11BQ15907 218 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 OR10K2Q6IF99 312 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 GAPTQ8N292 157 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP28Q9H239 520 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms