RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 DTD1Q8TEA8 209 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-204ENST00000587718 R3HDM4Q96D70 268 aa20.89■□□□□ 0.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 IFI27L2Q9H2X8 130 aa20.89■□□□□ 0.93
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF251Q9BRH9 671 aa20.83■□□□□ 0.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 CTRB2Q6GPI1 263 aa20.82■□□□□ 0.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR4A16Q8NH70 328 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MDFIQ99750 246 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCA1O95477 2261 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 NFYBP25208 207 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF134P52741 427 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 LTC4SQ16873 150 aa20.8■□□□□ 0.92
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