RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 POU2AF1Q16633 256 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4A47Q6IF82 309 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 SSX9Q7RTT3 188 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF152Q8N8N0 203 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4F4Q96R69 305 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFP57Q9NU63 452 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 BET1LQ9NYM9 111 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PN81 502 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMB8P28062 276 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CHRNA7P36544 502 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF45Q02386 682 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM65Q6PI78 240 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 TREML4Q6UXN2 200 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 LFNGQ8NES3 379 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 OR4A5Q8NH83 315 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 R3HDM4Q96D70 268 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 COPZ2Q9P299 210 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RABGGTA-208ENST00000558954 MARCH11A6NNE9 402 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MPPED1O15442 326 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 IGLV1-40P01703 118 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC6A1P30531 599 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MAS1LP35410 378 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LPAR6P43657 344 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 INPP1P49441 399 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIQKQ629K1 86 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 OR5M8Q8NGP6 311 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM68Q96MH6 324 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PHB2Q99623 299 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MGAM2Q2M2H8 2515 aa14.77□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 NUDT19A8MXV4 375 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 H0Y980 276 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PF4V1P10720 104 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF585BQ52M93 769 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM140Q9NV12 185 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SERPINE2P07093 398 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 FGF2P09038 288 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CD40LGP29965 261 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LCNL1Q6ZST4 164 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SPIN2AQ99865 258 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SOX15O60248 233 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 B3GALNT1O75752 331 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 KRASP01116 189 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RPA2P15927 270 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF695Q8IW36 515 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MSGN1A6NI15 193 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 HLA-GP17693 338 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 G6PCP35575 357 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 BAK1Q16611 211 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CADM3Q8N126 398 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TP53RKQ96S44 253 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 KLK15Q9H2R5 256 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR132Q9UNW8 380 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 H3BUA1 57 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 UPK2O00526 184 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PF4P02776 101 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 APELAP0DMC3 54 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB9AP51151 201 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms