RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-217	ENST00000550375	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.57	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	KBTBD11	O94819	623 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		13.56	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375		G3V318	75 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ACTL6B	O94805	426 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	IGF1	P05019	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	VDAC1	P21796	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	UCP1	P25874	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	ASAH1	Q13510	395 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	UPK2	O00526	184 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	OPN1MW	P04001	364 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	MYOD1	P15172	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	VAMP1	P23763	118 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	DHODH	Q02127	395 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
BRF1-217	ENST00000550375	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	APELA	P0DMC3	54 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	CD28	P10747	220 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SLC6A1	P30531	599 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	AKR1C2	P52895	323 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SLC35B1	P78383	322 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	TMEM187	Q14656	261 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	PHB2	Q99623	299 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.52	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	FBXO24	O75426	580 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	CDS2	O95674	445 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	TCRB	P04435	133 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	ANXA3	P12429	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	HLA-G	P17693	338 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	PPP1R1A	Q13522	171 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.51	□□□□□ -0.25
BRF1-217	ENST00000550375	SNAPC5	O75971	98 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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