RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TSPAN5P62079 268 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GNB1P62873 340 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 NDPQ00604 133 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DYRK1AQ13627 763 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ECSCRQ19T08 205 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 KCTD9Q7L273 389 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR52I2Q8NH67 350 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR4F4Q96R69 305 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 NUDT19A8MXV4 375 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 M0QYG6 137 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SULT1C2O00338 296 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CNIH1O95406 144 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 IGLL1P15814 213 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RCVRNP35243 200 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CFHR3Q02985 330 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FXYD3Q14802 87 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 COMMD1Q8N668 190 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 LFNGQ8NES3 379 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MCFD2Q8NI22 146 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 B9D2Q9BPU9 175 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 KLK15Q9H2R5 256 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PN81 502 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SPDEFO95238 335 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 IGHG4P01861 327 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ELANEP08246 267 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GNRHRP30968 328 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TNFSF8P32971 234 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CHRNA7P36544 502 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DGCR2P98153 550 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 FOXE3Q13461 319 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 IL18Q14116 193 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TMEM65Q6PI78 240 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TEX45Q8NA69 505 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR51H1Q8NH63 302 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MOB3AQ96BX8 217 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DUX3Q96PT4 197 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 LYSTQ99698 3801 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZFP57Q9NU63 452 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 U3KQE9 123 aa7.5□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 C3orf84H3BNL1 204 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SOX15O60248 233 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RAMP3O60896 148 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 CD3DP04234 171 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 APELAP0DMC3 54 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 PSMB8P28062 276 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 RAB9AP51151 201 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 UBE2KP61086 200 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 TNXAQ16473 311 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ACTBL2Q562R1 376 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SSX9Q7RTT3 188 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 ZNF695Q8IW36 515 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR5T1Q8NG75 326 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-217ENST00000550044 OR4S2Q8NH73 311 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms