RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 GABRA3P34903 492 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CTRLP40313 264 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 BTN3A2P78410 334 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 IL24Q13007 206 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 P2RY6Q15077 328 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 PRSS8Q16651 343 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 DEFB110Q30KQ9 67 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MORN2Q502X0 79 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 LEMD1Q68G75 181 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 FIGLAQ6QHK4 219 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 Q6ZSR3 168 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RNF144BQ7Z419 303 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 LINC01551Q86U37 167 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF329Q86UD4 541 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CHST4Q8NCG5 386 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 OR56B2PQ8NGI1 322 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MRAPQ8TCY5 172 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF721Q8TF20 911 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MOB3AQ96BX8 217 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 BTF3L4Q96K17 158 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 NICN1Q9BSH3 213 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM206AQ9NX38 181 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 NAT8Q9UHE5 227 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A0A0MQY5 61 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A1B0GX78 115 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 F6UZH7 168 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MS4A18H0YCH9 400 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM250H0YL14 139 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 H7C1C5 153 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 NDUFS8O00217 210 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 P2RY10O00398 339 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CCL25O15444 150 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 HCRTR1O43613 425 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 NPIPB7O75200 414 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 KBTBD11O94819 623 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 GAS8-AS1O95177 125 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 DIRAS3O95661 229 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 MT-ATP6P00846 226 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CSTAP01040 98 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV3-20P01619 116 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 IGLV3-1P01715 115 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 TTRP02766 147 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 OPN1LWP04000 364 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 HPNP05981 417 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 PRSS2P07478 247 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC35E2P0CK97 266 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CTLA4P16410 223 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 GZMHP20718 246 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CRYGSP22914 178 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 DTYMKP23919 212 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 NPBWR2P48146 333 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RAB7AP51149 207 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 TAS2R30P59541 319 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 HILS1P60008 231 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 LCN6P62502 163 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 PAFAH1B2P68402 229 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 HIST1H3AP68431 136 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 SRPXP78539 464 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 SGCBQ16585 318 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 ASCL4Q6XD76 172 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 SSX7Q7RTT5 188 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAFD1-204ENST00000548092 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms