RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541175.1

PRR4-208, Transcript of proline rich 4, human

TSL 2

Gene PRR4, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-208	ENST00000541175	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175		K7EP13	123 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CYB5B	O43169	146 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CA11	O75493	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	GPX5	O75715	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ISG15	P05161	165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SOX2	P48431	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	KISS1	Q15726	138 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	DIRAS1	O95057	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	YIF1A	O95070	293 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	M6PR	P20645	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75	9e-9	■■■■□ 21.8
PRR4-208	ENST00000541175	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	FGGY	Q96C11	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	GPER1	Q99527	375 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CBY3	A6NI87	242 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175		M0R1X1	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	NXPH4	O95158	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	KRT8	P05787	483 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CCR9	P51686	369 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	CXCR4	P61073	352 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OR5I1	Q13606	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TPBG	Q13641	420 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	S100A13	Q99584	98 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRR4-208	ENST00000541175	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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