RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZUT4 128 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LHFPL1Q86WI0 220 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T33Q8NG76 320 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q9HAA7 133 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PXDNQ92626 1479 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALS2Q96Q42 1657 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHD4Q14839 1912 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGS12O14924 1447 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LMO7Q8WWI1 1683 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A087X0T9 212 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HMSDA8MTL9 139 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 J3QT63 122 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ISLRO14498 428 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTHP01270 115 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLA-DRB1P01911 266 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTLA4P16410 223 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSMB8P28062 276 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLA-DRB3P79483 266 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLGLB1Q02325 96 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTC32Q5I0X7 151 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FKBP1CQ5VVH2 108 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T2Q6IF00 324 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZSN1 163 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SSX8Q7RTT4 187 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGF14Q92915 247 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C2orf48Q96LS8 159 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 YPEL4Q96NS1 127 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NCKAP5O14513 1909 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00473A8K010 186 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 F6UB75 175 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC17A2O00624 439 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NTN1O95631 604 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HLA-DQB1P01920 261 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DRD3P35462 400 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SELENOPP49908 381 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATP4BP51164 291 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM258P61165 79 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DAD1P61803 113 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GSG1Q2KHT4 349 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCN12Q6JVE5 192 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC00471Q8N535 108 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T6Q8NHC8 308 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM168AQ92567 244 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM230Q96A57 120 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CARD19Q96LW7 228 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IMMP2LQ96T52 175 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 THTPAQ9BU02 230 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms