RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519474.5

HDAC3-215, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 736 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-215ENST00000519474 C9orf170A2RU37 121 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 CENPXA8MT69 81 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 TMEM238C9JI98 176 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 H7C2Y5 167 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 SOX15O60248 233 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 TNFAIP8O95379 198 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 IGKV1-16P04430 117 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 SMIM18P0DKX4 95 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 VDAC1P21796 283 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 DTYMKP23919 212 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 SERPINB10P48595 397 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 RAB9AP51151 201 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 SLAQ13239 276 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 ZNF846Q147U1 533 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 ACTBL2Q562R1 376 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 TMEM65Q6PI78 240 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 MRAPQ8TCY5 172 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 C5orf30Q96GV9 206 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 CLCC1Q96S66 551 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 TMEM140Q9NV12 185 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 KIAA1456Q9P272 454 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 NAGKQ9UJ70 344 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC3-215ENST00000519474 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 I3L521 148 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 K7EIL1 84 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 M0R1X1 148 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 CRYGBP07316 175 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 OR5H8P0DN80 308 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 NDPQ00604 133 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 MXD1Q05195 221 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ARFRP1Q13795 201 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 DEFB136Q30KP8 78 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 S100ZQ8WXG8 99 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 GNB4Q9HAV0 340 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PARP11Q9NR21 331 aa7.27□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 NOTCH1P46531 2555 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 IGLV2-23P01705 113 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 LGALS7P47929 136 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 AKR1D1P51857 326 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 CD81P60033 236 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ZNF45Q02386 682 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ARL6IP1Q15041 203 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 NEDD8Q15843 81 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 BVESQ8NE79 360 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 OR11H1Q8NG94 326 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PRRT1Q99946 306 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 MFFQ9GZY8 342 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 TMEM235A6NFC5 223 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 J3QRK9 145 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 CTDSP2O14595 271 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 HLA-DQB1P01920 261 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 CLEC3BP05452 202 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 STAG3L2P0CL84 134 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 TGFBR1P36897 503 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 RUNX1Q01196 453 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 FXYD3Q14802 87 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PLGLAQ15195 96 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 TMEM177Q53S58 311 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 IDNKQ5T6J7 187 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC3-215ENST00000519474 PDPNQ86YL7 162 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms