RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 SHOXO15266 292 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 CDS2O95674 445 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1D-33P01593 117 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1-33P01594 117 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-16P61578 105 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 EBI3Q14213 229 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TATDN3Q17R31 274 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF585BQ52M93 769 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM177Q53S58 311 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 PIFOQ8TCI5 191 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 MITD1Q8WV92 249 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IL22RA2Q969J5 263 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM56Q96MV1 263 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 COMMD9Q9P000 198 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.02□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 RAMP3O60896 148 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO24O75426 580 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1-16P04430 117 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 NQO2P16083 231 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM11P17152 192 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 FBLN7Q53RD9 439 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM219Q86XT9 240 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 LRTM2Q8N967 370 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 OR52B4Q8NGK2 314 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 HARBI1Q96MB7 349 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 OR51J1Q9H342 316 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF702PQ9H963 129 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.01□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 C7orf66A4D0T2 115 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SSNA1O43805 119 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 S1PR2O95136 353 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IFNA21P01568 189 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 CD28P10747 220 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 CD24P25063 80 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 HNF4GQ14541 408 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD55Q3KP44 614 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZNX1 250 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 FAM219AQ8IW50 185 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 UXS1Q8NBZ7 420 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 DMBX1Q8NFW5 382 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 R3HDM4Q96D70 268 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 RHOVQ96L33 236 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1456Q9P272 454 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TCF19Q9Y242 345 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 ALG5Q9Y673 324 aa9□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 MARCH11A6NNE9 402 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SPDEFO95238 335 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 KRASP01116 189 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 VDAC1P21796 283 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 AKR1C2P52895 323 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 MMDQ15546 238 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 POU2AF1Q16633 256 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 LIN54Q6MZP7 749 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 REC114Q7Z4M0 266 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 CADM3Q8N126 398 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.99□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 A6NDX4 124 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 M0QZK8 103 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 NBR2O15453 112 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SNAPC5O75971 98 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 OR2F2O95006 317 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 OR2A4O95047 310 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1-39P01597 117 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1D-39P04432 117 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 G6PCP35575 357 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2KP61086 200 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 PLGLAQ15195 96 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 PSG5Q15238 335 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SSX9Q7RTT3 188 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 Q8N2B8 174 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 Q8N6K4 173 aa8.98□□□□□ -0.97
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35G3Q8N808 338 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms