RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TNC	P24821	2201 aa		12.89	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	RAMP3	O60896	148 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	KBTBD11	O94819	623 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	RAB3D	O95716	219 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV1-40	P01703	118 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PRSS8	Q16651	343 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM65	Q6PI78	240 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	MMD2	Q8IY49	270 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	RHOV	Q96L33	236 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SOST	Q9BQB4	213 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148		U3KQK5	164 aa		12.88	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ACTL6B	O94805	426 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR2A4	O95047	310 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	HPRT1	P00492	218 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	AKAIN1	P0CW23	69 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TAS2R31	P59538	309 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TNXA	Q16473	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	LFNG	Q8NES3	379 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM68	Q96MH6	324 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR2A7	Q96R45	310 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ASCL2	Q99929	193 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	COMMD9	Q9P000	198 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148		V9GYH0	126 aa		12.87	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	RYR2	Q92736	4967 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PGAM2	P15259	253 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	NQO2	P16083	231 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	F2R	P25116	425 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	CD40LG	P29965	261 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ECI1	P42126	302 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PPP5C	P53041	499 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PHB2	Q99623	299 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	KLK15	Q9H2R5	256 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	GNB4	Q9HAV0	340 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		12.86	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	ERVK-16	P61578	105 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	POU2AF1	Q16633	256 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SSX9	Q7RTT3	188 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR4A5	Q8NH83	315 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	BET1L	Q9NYM9	111 aa		12.85	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SORL1	Q92673	2214 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	SOX15	O60248	233 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	S1PR2	O95136	353 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	MAS1L	P35410	378 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	RND3	P61587	244 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	PYDC2	Q56P42	97 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR4A47	Q6IF82	309 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	TERB2	Q8NHR7	220 aa		12.84	□□□□□ -0.35
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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