RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	INSL6	Q9Y581	213 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	REG1B	P48304	166 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDCD1	Q15116	288 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1C1	Q15619	314 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMG4	Q5JS54	123 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SYT8	Q8NBV8	401 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOO	Q9BUR5	198 aa		6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		C9JCJ5	164 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD38	P28907	300 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSG5	Q15238	335 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NMS	Q5H8A3	153 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF208	Q9H0X6	261 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PRE2	83 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBR1	Q16650	682 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CT55	Q8WUE5	264 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RDH5	Q92781	318 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF183	Q96D59	192 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEC1	Q9P2X7	70 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		R4GN57	208 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCT	P09848	1927 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GTF3C1	Q12789	2109 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf51	C9J302	202 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	HES1	Q14469	280 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CA13	Q8N1Q1	262 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAX2	Q96IS3	184 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FREM3	P0C091	2139 aa		6.93	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BVH4	76 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACTL6B	O94805	426 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1D-16	P01601	117 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNT2	P09544	360 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSG4	Q00888	419 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ODF1	Q14990	250 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GUSBP1	Q15486	140 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	FHL5	Q5TD97	284 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	VSTM2L	Q96N03	204 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR82	Q96P67	336 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	DECR2	Q9NUI1	292 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	JPT1	Q9UK76	154 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q9Y3F1	56 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM50A	O95807	157 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	EMP1	P54849	157 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNG3	P63215	75 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL14	Q16627	93 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIGY	Q3MUY2	71 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf99	Q6UX52	265 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNA1D	Q01668	2161 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELA3B	P08861	270 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCHFR	P30047	84 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	HBB	P68871	147 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEUROG1	Q92886	237 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	STARD5	Q9NSY2	213 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERG28	Q9UKR5	140 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM189	A5PLL7	270 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDA	P32320	146 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZNB5	142 aa		6.91	□□□□□ -1.3

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