RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496530.1

SMARCD3-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCD3, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3-215ENST00000496530 PDPNQ86YL7 162 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR4A16Q8NH70 328 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PIFOQ8TCI5 191 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 HARBI1Q96MB7 349 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 HINT2Q9BX68 163 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FBXL15Q9H469 300 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FGF16O43320 207 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SLC25A17O43808 307 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CHST1O43916 411 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 ADAP1O75689 374 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 B3GALNT1O75752 331 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 ACTL6BO94805 426 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 NXPH3O95157 252 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CDS2O95674 445 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OPN1MWP04001 364 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PROK1P58294 105 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SRPXP78539 464 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PSG5Q15238 335 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 MMDQ15546 238 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR1S1Q8NH92 325 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 GPR146Q96CH1 333 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 RHOVQ96L33 236 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 NSG2Q9Y328 171 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 A0A1B0GVG6 124 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CCSO14618 274 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 GOSR2O14653 212 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR2A4O95047 310 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 IFNA17P01571 189 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 UCP1P25874 307 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TMEM177Q53S58 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 Q6ZNX1 250 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 Q8N2B8 174 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SLC35G3Q8N808 338 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 MITD1Q8WV92 249 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 DDB2Q92466 427 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CFHR4Q92496 578 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 GALNT14Q96FL9 552 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TMEM56Q96MV1 263 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR2A7Q96R45 310 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 RNF5Q99942 180 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CITED1Q99966 193 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 ZNF702PQ9H963 129 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 UPK2O00526 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FCN1O00602 326 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 RRHO14718 337 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 NBR2O15453 112 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 KCNAB3O43448 404 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FBXO24O75426 580 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SCGB1D2O95969 90 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 IGKV1-39P01597 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 IGKV1D-39P04432 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 BLCAPP62952 87 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 SLC35B1P78383 322 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FCN2Q15485 313 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TNXAQ16473 311 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TEX45Q8NA69 505 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 GON7Q9BXV9 100 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 TMEM140Q9NV12 185 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 A0A0B4J2A0 478 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 HMX3A6NHT5 357 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCD3-215ENST00000496530 MARCH11A6NNE9 402 aa6.48□□□□□ -1.37
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