RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	PPP5C	P53041	499 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	UCP3	P55916	312 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TSPAN5	P62079	268 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF45	Q02386	682 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR9G9	P0C7N8	305 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2A4	O95047	310 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	CNIH1	O95406	144 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	AREG	P15514	252 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	F2R	P25116	425 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TAS2R19	P59542	299 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TP53RK	Q96S44	253 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	NSG2	Q9Y328	171 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	CCL24	O00175	119 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	UPK2	O00526	184 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	HPRT1	P00492	218 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TRBV12-3	P01733	135 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	G6PC	P35575	357 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	DEFA6	Q01524	100 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	CBX3	Q13185	183 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	FHL3	Q13643	280 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM140	Q9NV12	185 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A087WW49	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487		A6NHS1	94 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	WIPF1	O43516	503 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	KRAS	P01116	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	REG1A	P05451	166 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	KIR2DS2	P43631	304 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	CATR1	Q13166	79 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	BAK1	Q16611	211 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SP6	Q3SY56	376 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	POC5	Q8NA72	575 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	MPPED1	O15442	326 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	IGKV1-5	P01602	117 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	PF4	P02776	101 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TRGV3	P03979	118 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	PGAM2	P15259	253 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TBP	P20226	339 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	MYCNOS	P40205	109 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	ETV6	P41212	452 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	SLURP1	P55000	103 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	PIGP	P57054	158 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TPPP2	P59282	170 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	TAS2R31	P59538	309 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	OR2B8P	P59922	312 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	RND3	P61587	244 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	RUNX1	Q01196	453 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CIZ1-222	ENST00000491487	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.4	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms