RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CITED4Q96RK1 184 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SULT1C2O00338 296 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 FCGR2CP31995 323 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 HSPA13P48723 471 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 FXYD4P59646 89 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CD81P60033 236 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 NEDD8Q15843 81 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 C15orf32Q32M92 178 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CNIH2Q6PI25 160 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 MMD2Q8IY49 270 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SNAPC3Q92966 411 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 USMG5Q96IX5 58 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 VCX3BQ9H321 246 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TUBA4BQ9H853 241 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 PALMDQ9NP74 551 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SSR3Q9UNL2 185 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 C2orf70A6NJV1 201 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ACTL6BO94805 426 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 KBTBD11O94819 623 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR2A4O95047 310 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 BRI3O95415 125 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 DIRAS3O95661 229 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 FOLR2P14207 255 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 GUCA2BQ16661 112 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 BEST4Q8NFU0 473 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM68Q96MH6 324 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR2A7Q96R45 310 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SPIN2AQ99865 258 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 NEURL2Q9BR09 285 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 MLXQ9UH92 298 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 LCE6AA0A183 80 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM223BA6NKX1 122 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 A8MZ25 164 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 H0Y980 276 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 S1PR2O95136 353 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF735P0CB33 412 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CD36P16671 472 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 GALP22466 123 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ARPC4P59998 168 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TATDN3Q17R31 274 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TM4SF20Q53R12 229 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4A47Q6IF82 309 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM17Q86X19 198 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 HOGA1Q86XE5 327 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 Q8N402 240 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR51H1Q8NH63 302 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4S2Q8NH73 311 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SPATA25Q9BR10 227 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 NSG2Q9Y328 171 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF320A2RRD8 509 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM213A2RRL7 107 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 DPPA5A6NC42 116 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 PPYP01298 95 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CTXN2P0C2S0 81 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CTRB1P17538 263 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 HLA-GP17693 338 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 PSMB6P28072 239 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 ARL3P36405 182 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 RFX2P48378 723 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 MFAP2P55001 183 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 OR2B8PP59922 312 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C5-210ENST00000489842 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms