RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 NECAP1Q8NC96 275 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 C5orf30Q96GV9 206 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ETV7Q9Y603 341 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF320A2RRD8 509 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGHV3-23P01764 117 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 FCGR3AP08637 254 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 GSTT2P0CG29 244 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 GSTT2BP0CG30 244 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMIM18P0DKX4 95 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CBLN1P23435 193 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 MXD1Q05195 221 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPIN2AQ99865 258 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A0A6YYH2 397 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 A6NJ64 397 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 LGALS9O00182 355 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 GNB3P16520 340 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARL3P36405 182 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM209BQ5JX69 171 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 GINS4Q9BRT9 223 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 S4R3C0 116 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DPPA5A6NC42 116 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 HMX3A6NHT5 357 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC00473A8K010 186 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 J3QRK9 145 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 NDUFB8O95169 186 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DTYMKP23919 212 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 TGFBR1P36897 503 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CDK10Q15131 360 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 TM4SF20Q53R12 229 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 IDNKQ5T6J7 187 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 HACD4Q5VWC8 232 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 LYG2Q86SG7 212 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 MMD2Q8IY49 270 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 MLXQ9UH92 298 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPATA2Q9UM82 520 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPRY2O43597 315 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DEDDO75618 318 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 CDNFQ49AH0 187 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 BTNL8Q6UX41 500 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 GPHB5Q86YW7 130 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A075B6Q4 140 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM213A2RRL7 107 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 FCGR3BO75015 233 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 GABARAPO95166 117 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 TNFRSF9Q07011 255 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 ARFRP1Q13795 201 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 DEFB135Q30KP9 77 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM235A6NFC5 223 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 BMI1P35226 326 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 TALDO1P37837 337 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 ALDH3B2P48448 385 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 APOC4P55056 127 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAPPC10-210ENST00000483973 NCS1P62166 190 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms