RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SPACA5Q96QH8 159 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 VSIG4Q9Y279 399 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 LAMA3Q16787 3333 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 DLEU1O43261 78 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 H2BFSP57053 126 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 RIGQ13278 110 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.51□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 NGFP01138 241 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 KIR2DS2P43631 304 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 FAM219AQ8IW50 185 aa6.51□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SFRP2Q96HF1 295 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SMIM8Q96KF7 97 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 JMJD8Q96S16 334 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 MSL2Q9HCI7 577 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 CXorf1O96002 111 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 HPRT1P00492 218 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 FAM27E3Q08E93 113 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 RPEQ96AT9 228 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 Q96M66 194 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 GPR132Q9UNW8 380 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 BMI1P35226 326 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 Q56UQ5 140 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 LIPFP07098 398 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 HERVK_113P61574 105 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 GINS3Q9BRX5 216 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 PARLQ9H300 379 aa6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 CHODLQ9H9P2 273 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 IGHV1-2P23083 117 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 OR2T8A6NH00 312 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 C3orf80F5H4A9 247 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 MGST3O14880 152 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 ZNHIT1O43257 154 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 RND3P61587 244 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 KBTBD11O94819 623 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP54-210ENST00000466048 FAM168AQ92567 244 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 AUP1Q9Y679 476 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 HELTA6NFD8 242 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-210ENST00000466048 HLA-DRB1P01911 266 aa6.49□□□□□ -1.37
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