RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 PYDC2Q56P42 97 aa16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 PRRT1Q99946 306 aa16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 BET1LQ9NYM9 111 aa16.09■□□□□ 0.17
IMP4-209ENST00000462357 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.09■□□□□ 0.17
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IMP4-209ENST00000462357 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 C8orf86Q6ZUL3 223 aa16.08■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.08■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 TSC22D3Q99576 134 aa16.07■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.07■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa16.07■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.06■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 C19orf54Q5BKX5 351 aa16.06■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.06■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 CADM3Q8N126 398 aa16.06■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 OR5T1Q8NG75 326 aa16.06■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.06■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.06■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 FKBP11Q9NYL4 201 aa16.06■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 INPP1P49441 399 aa16.05■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 BRWD1-AS2P59051 145 aa16.05■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 RND3P61587 244 aa16.05■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 OR4A47Q6IF82 309 aa16.05■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 Q8N402 240 aa16.05■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.04■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 MARCH11A6NNE9 402 aa16.04■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 OR9G9P0C7N8 305 aa16.04■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 MS4A10Q96PG2 267 aa16.04■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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IMP4-209ENST00000462357 OR1N2Q8NGR9 330 aa16.03■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 TMEM140Q9NV12 185 aa16.03■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 MCUBQ9NWR8 336 aa16.03■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa16.02■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 UPK2O00526 184 aa16.02■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 ETV6P41212 452 aa16.02■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 PPP5CP53041 499 aa16.02■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 ZNF616Q08AN1 781 aa16.02■□□□□ 0.16
IMP4-209ENST00000462357 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.02■□□□□ 0.16
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