RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323		K7EP34	96 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	NMU	P48645	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	RHOG	P84095	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323		A0A0G2JLM5	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C4orf51	C9J302	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	CHST1	O43916	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	GPR82	Q96P67	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PPP1CA	P62136	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	EML2	O95834	649 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	IL11RA	Q14626	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323		K7EQS6	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	HBZ	P02008	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	LTBR	P36941	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TNFSF11	O14788	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	IGHM	P01871	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	CTSB	P07858	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	COL9A1	P20849	921 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	RRAD	P55042	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PRSS8	Q16651	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PPY	P01298	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SIRPB1	O00241	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	GAPT	Q8N292	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PERP	Q96FX8	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	SERF2	P84101	59 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF708	P17019	499 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	EDDM3B	P56851	147 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MUC4-208	ENST00000462323	AMELY	Q99218	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.2 ms