RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM68Q96MH6 324 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 OR2W1Q9Y3N9 320 aa10.23□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00473A8K010 186 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV2-14P01704 120 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 GNG2P59768 71 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 RTL8BQ17RB0 113 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 TEX45Q8NA69 505 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 OR5B12Q96R08 314 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.22□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 H3BUA1 57 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 SHOXO15266 292 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 PRAF2O60831 178 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 TUSC2O75896 110 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 SLC22A5O76082 557 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 UBE2KP61086 200 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 CBX3Q13185 183 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 DCUN1D4Q92564 292 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 HARBI1Q96MB7 349 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
C9orf3-210ENST00000462125 DNAH9Q9NYC9 4486 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01619G3V211 115 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 OVOL1O14753 267 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 CNIH1O95406 144 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TCRBP04435 133 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 RCVRNP35243 200 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TAS2R19P59542 299 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TATDN3Q17R31 274 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 GPX8Q8TED1 209 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 MS4A10Q96PG2 267 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 B9D2Q9BPU9 175 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.2□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WW49 117 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 CCNKO75909 580 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 CRYZL1O95825 349 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 AKAIN1P0CW23 69 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TBPP20226 339 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 BTCP35070 178 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 ECI1P42126 302 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TPPP2P59282 170 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS8Q16651 343 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF429Q86V71 674 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 HOGA1Q86XE5 327 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 OR5T1Q8NG75 326 aa10.19□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0G2JLM5 398 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 C7orf66A4D0T2 115 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-11P01762 117 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TRGV3P03979 118 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 AADACP22760 399 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 CBX5P45973 191 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 SLURP1P55000 103 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 MEF2DQ14814 521 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 MSMO1Q15800 293 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 BEST4Q8NFU0 473 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 KLK11Q9UBX7 282 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa10.18□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 COL7A1Q02388 2944 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 MSGN1A6NI15 193 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 FCGR3BO75015 233 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 CDK10Q15131 360 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 ACSM6Q6P461 480 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 KCTD9Q7L273 389 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 NUDT15Q9NV35 164 aa10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
C9orf3-210ENST00000462125 ALG5Q9Y673 324 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms