RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460132.5

PLOD3-208, Transcript of procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, human

TSL 3

Gene PLOD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF45	Q02386	682 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132		A0A1B0GW64	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	APOA1	P02647	267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ELK1	P19419	428 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	MAS1L	P35410	378 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RORC	P51449	518 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HERV-K104	P61576	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RHOG	P84095	191 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	CATR1	Q13166	79 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	CTF1	Q16619	201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM223B	A6NKX1	122 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HPGDS	O60760	199 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF735	P0CB33	412 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	MYOD1	P15172	320 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	TAS2R46	P59540	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR4A47	Q6IF82	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	GPX8	Q8TED1	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR2J3	O76001	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	GABARAP	O95166	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HPRT1	P00492	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	AREG	P15514	252 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HLA-G	P17693	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HRH1	P35367	487 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	TAS2R31	P59538	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	NECAP1	Q8NC96	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SORL1	Q92673	2214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	S1PR2	O95136	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	GP9	P14770	177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	NQO2	P16083	231 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	POU2AF1	Q16633	256 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	ASCL2	Q99929	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	BMPR1B	O00238	502 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	UPK2	O00526	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RLN1	P04808	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	CRYGC	P07315	174 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	RPA2	P15927	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	PSMB6	P28072	239 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	OR2B8P	P59922	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM140	Q9NV12	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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