RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 ADIPOQQ15848 244 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 NUP37Q8NFH4 326 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 PF4P02776 101 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 CELA3BP08861 270 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 LTBRP36941 435 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 DLX6P56179 175 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF56Q15929 161 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 SPATA45Q537H7 98 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 VWCEQ96DN2 955 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TRGV3P03979 118 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 IFI6P09912 130 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 DPH3Q96FX2 82 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GPR82Q96P67 336 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 RAXQ9Y2V3 346 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SRIP30626 198 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SHISA3A0PJX4 238 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 C12orf77C9JDV5 145 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 C9JCJ5 164 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF146Q15072 292 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 FOXH1O75593 365 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 AGAP20933 346 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 LEPROTL1O95214 131 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 PRSS2P07478 247 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GLRXP35754 106 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GCGP01275 180 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SPSB4Q96A44 273 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SMIM8Q96KF7 97 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV1D-33P01593 117 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 IGKV1-33P01594 117 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 DNLZQ5SXM8 178 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 AICDAQ9GZX7 198 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MUC21Q5SSG8 566 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 PARLQ9H300 379 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MT-ND6P03923 174 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 CSRP3P50461 194 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 POC1AQ8NBT0 407 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 M0QZK8 103 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TCF21O43680 179 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SMAGPQ0VAQ4 97 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ATOH7Q8N100 152 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV1-2P23083 117 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 C7orf71A4D174 169 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 HLA-DQA1P01909 254 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 CDKN1AP38936 164 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 OR1P1Q8NH06 330 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TAS2R60P59551 318 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ICAM4Q14773 271 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GALNT14Q96FL9 552 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 C17orf98A8MV24 154 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TFF1P04155 84 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF708P17019 499 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 GCHFRP30047 84 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PRX2 142 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM262E9PQX1 116 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 PSG7Q13046 419 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 OR4A47Q6IF82 309 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 DANCRP0C864 163 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TNFSF10P50591 281 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 PSMB11A5LHX3 300 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 UMODP07911 640 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 TFF3Q07654 80 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 CENPWQ5EE01 88 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms