RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	MAGEA2	P43356	314 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RBP2	P50120	134 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB7A	P51149	207 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HCCS	P53701	268 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ATP1B3	P54709	279 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MADCAM1	Q13477	382 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	APOF	Q13790	326 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KIR2DS1	Q14954	304 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF429	Q86V71	674 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DHFR2	Q86XF0	187 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	STPG2	Q8N412	459 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DRAM1	Q8N682	238 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CHST4	Q8NCG5	386 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR9G1	Q8NH87	305 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PP6455	Q8WZ26	134 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ISOC1	Q96CN7	298 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C10orf35	Q96D05	121 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	EHF	Q9NZC4	300 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HHLA2	Q9UM44	414 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		R4GMQ9	66 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		V9GYS6	101 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ODAM	A1E959	279 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LY6L	H3BQJ8	138 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SIRPB1	O00241	398 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CCRL2	O00421	344 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DEGS1	O15121	323 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MPZL2	O60487	215 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ENTPD6	O75354	484 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2H2	O95918	312 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM107A	O95990	144 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CST1	P01037	141 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1D-33	P01593	117 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1-33	P01594	117 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGLV3-1	P01715	115 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHG2	P01859	326 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5H8	P0DN80	308 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ANXA8	P13928	327 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PRKACA	P17612	351 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ATP6V1B2	P21281	511 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IL3RA	P26951	378 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ATP6V1E1	P36543	226 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GLP1R	P43220	463 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CXCR4	P61073	352 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CDK5	Q00535	292 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	AES	Q08117	197 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	UBE2V2	Q15819	145 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TCF23	Q7RTU1	214 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MOB3B	Q86TA1	216 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LINC01551	Q86U37	167 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8H3	Q8N146	312 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR11H1	Q8NG94	326 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR56B4	Q8NH76	319 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	APOL4	Q9BPW4	351 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CHST5	Q9GZS9	411 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM107B	Q9H098	131 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RHOF	Q9HBH0	211 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		2.57	□□□□□ -2

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