RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ETV7Q9Y603 341 aa15.91■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 A6NJ64 397 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF735P0CB33 412 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS2P43631 304 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD4AQ8N468 514 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-208ENST00000428064 Q9H521 79 aa15.9■□□□□ 0.14
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LIMS1-208ENST00000428064 SPATA2Q9UM82 520 aa15.89■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 OR2J3O76001 311 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 HRASP01112 189 aa15.88■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 BEST4Q8NFU0 473 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.88■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 HMX3A6NHT5 357 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 E7EUB6 86 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM127O75204 238 aa15.87■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 ARPC4P59998 168 aa15.87■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF773Q6PK81 442 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 HOGA1Q86XE5 327 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 OR4A5Q8NH83 315 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 BET1LQ9NYM9 111 aa15.87■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 LCE6AA0A183 80 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GW64 132 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 DPPA5A6NC42 116 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 IFNA6P05013 189 aa15.86■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.86■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.86■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 C2orf70A6NJV1 201 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 PPP5D1E7EU14 171 aa15.85■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC140Q96MF4 163 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 NEURL2Q9BR09 285 aa15.85■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.85■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF785A8K8V0 405 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TPPPO94811 219 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 PPYP01298 95 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 FOLR2P14207 255 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-GP17693 338 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 FCGR2CP31995 323 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 MXD1Q05195 221 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 POU2AF1Q16633 256 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.84■□□□□ 0.13
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LIMS1-208ENST00000428064 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.84■□□□□ 0.13
LIMS1-208ENST00000428064 A8MWP6 167 aa15.83■□□□□ 0.12
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LIMS1-208ENST00000428064 AREGP15514 252 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R31P59538 309 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CATR1Q13166 79 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 OR4A47Q6IF82 309 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf35Q6ZS72 473 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 AUNIPQ9H7T9 357 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.83■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CGB1A6NKQ9 187 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB8O95169 186 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 ARL3P36405 182 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 CBX5P45973 191 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 IDNKQ5T6J7 187 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 SSX9Q7RTT3 188 aa15.82■□□□□ 0.12
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.82■□□□□ 0.12
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