RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427771.1

TRAK1-205, Transcript of trafficking kinesin protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAK1, Length 900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1-205ENST00000427771 FAM25AB3EWG3 89 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 FAM25CB3EWG5 89 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 FAM25GB3EWG6 89 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 TEX22C9J3V5 150 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 SAP30O75446 220 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 BRI3O95415 125 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 TRBV12-3P01733 135 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF45Q02386 682 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 CATR1Q13166 79 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 SPIN2AQ99865 258 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.67□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 HRASP01112 189 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 RLN1P04808 185 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 SPCS2Q15005 226 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 OR4A47Q6IF82 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ACSM6Q6P461 480 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 MZT2AQ6P582 158 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 AP3S1Q92572 193 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 S1PR2O95136 353 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 INSL3P51460 131 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 RHOGP84095 191 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF429Q86V71 674 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAK1-205ENST00000427771 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 AREGP15514 252 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 RPA2P15927 270 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 RCVRNP35243 200 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 USMG5Q96IX5 58 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 BET1LQ9NYM9 111 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 CGB1A6NKQ9 187 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 LY86O95711 162 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 HPRT1P00492 218 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF735P0CB33 412 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 HLA-GP17693 338 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 ZP3P21754 424 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 MAS1LP35410 378 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 TAS2R31P59538 309 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 SORL1Q92673 2214 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 COL7A1Q02388 2944 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 FAM223BA6NKX1 122 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 M0QYG6 137 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 OR2J3O76001 311 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 NQO2P16083 231 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 SPNP16150 400 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 TSPAN5P62079 268 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 POU2AF1Q16633 256 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 OR4A5Q8NH83 315 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 BORCS5Q969J3 196 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 TMEM140Q9NV12 185 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 KLK11Q9UBX7 282 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 GPR31O00270 319 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 UPK2O00526 184 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 REG1AP05451 166 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 SYNJ2BPP57105 145 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 CD69Q07108 199 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 LAX1Q8IWV1 398 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 DMBX1Q8NFW5 382 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 OR52I2Q8NH67 350 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 ABHD1Q96SE0 405 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 B9D2Q9BPU9 175 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 COMMD9Q9P000 198 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 DPPA5A6NC42 116 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAK1-205ENST00000427771 F2RP25116 425 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms