RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417400.1

CITED1-203, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-203	ENST00000417400	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		E7EUB6	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MYL12B	O14950	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	OR2J3	O76001	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MYOD1	P15172	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	AADAC	P22760	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CD40LG	P29965	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM50B	P56557	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RCN1	Q15293	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TNXA	Q16473	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PRSS8	Q16651	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PHB2	Q99623	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		Q9N2K0	584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PKD1	P98161	4303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		A0A1B0GVY2	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	AIRE	O43918	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	NDUFB8	O95169	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	APOA2	P02652	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CDK1	P06493	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UBB	P0CG47	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CD37	P11049	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SRM	P19623	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CBLN1	P23435	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LGALS7	P47929	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	NHLH2	Q02577	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	P2RY14	Q15391	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SPHAR	Q15513	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF124	Q15973	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	THRSP	Q92748	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	NEU1	Q99519	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400		A0A0B4J203	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LGALS9	O00182	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SPRY2	O43597	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CRYZL1	O95825	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	AREG	P15514	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CTRB1	P17538	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZBTB25	P24278	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CLDN12	P56749	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MED22	Q15528	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CITED1-203	ENST00000417400	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms