RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 MSGN1A6NI15 193 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ODF3BA8MYP8 253 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SSSCA1O60232 199 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HTR1DP28221 377 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 PAX9P55771 341 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 RAB14P61106 215 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ARF6P62330 175 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF266Q14584 549 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 STX12Q86Y82 276 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 BAP18Q8IXM2 172 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 STPG2Q8N412 459 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ST8SIA2Q92186 375 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CLCC1Q96S66 551 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SIRPDQ9H106 197 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM140Q9NV12 185 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 DPM3Q9P2X0 92 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 C15orf61A6NNL5 157 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 UPK2O00526 184 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SHOXO15266 292 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 DFFBO76075 338 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 GATA3P23771 443 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CD1BP29016 333 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SULT1A1P50225 295 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CAV2P51636 162 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HBG1P69891 147 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HBG2P69892 147 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 RELBQ01201 579 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ATP6V1FQ16864 119 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CLLU1Q5K131 121 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 OR4A47Q6IF82 309 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 PNKDQ8N490 385 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TEX45Q8NA69 505 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 OR5B3Q8NH48 314 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 RPEQ96AT9 228 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 MBD6Q96DN6 1003 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf159Q96HA4 380 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ARV1Q9H2C2 271 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 RBKSQ9H477 322 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 PSENENQ9NZ42 101 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 H7C2Y5 167 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 ARG1P05089 322 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 OR9G9P0C7N8 305 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2E1P51965 193 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00205P59089 165 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 PAX8Q06710 450 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 DTD1Q8TEA8 209 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HARBI1Q96MB7 349 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 FBXL17Q9UF56 701 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 KBTBD11O94819 623 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TOX4O94842 621 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SPDEFO95238 335 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM50AO95807 157 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 IFNA17P01571 189 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1-16P04430 117 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 SEC11BP0C7V7 166 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 MAS1LP35410 378 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS4P56470 323 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 LCN2P80188 198 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 HCP5Q6MZN7 132 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-202ENST00000409024 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.92□□□□□ -1.14
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