RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL8P10145 99 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN6P56747 220 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CX3CL1P78423 397 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf61Q13536 156 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C18orf15Q96N68 181 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM206AQ9NX38 181 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TRANK1O15050 2925 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EQS6 105 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NTN1O95631 604 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHG3P01860 377 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf79P0CE67 100 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 IFITM1P13164 125 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ECI1P42126 302 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HHEXQ03014 270 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1C1Q15619 314 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RND1Q92730 232 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MPDU1O75352 247 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HSBP1O75506 76 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP1B1P05026 303 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FSTP19883 344 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LCN6P62502 163 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HERVK_113P63121 156 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF550Q7Z398 422 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 AQP3Q92482 292 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 IL36GQ9NZH8 169 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CATP04040 527 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF708P17019 499 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFRSF4P43489 277 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SSR4P51571 173 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXW4P57775 412 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GUSBP1Q15486 140 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CD207Q9UJ71 328 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NXPH3O95157 252 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00869P0C866 280 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MFAP5Q13361 173 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC32Q5I0X7 151 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf44Q96CB5 159 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GX51 115 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF286BP0CG31 522 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PIP4P1Q86T03 277 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PRELID3AQ96N28 172 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01553A4QN01 128 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR32B1ATL7 298 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF253O75346 499 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 STC1P52823 247 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C3Q8NH37 302 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DDIT4LQ96D03 193 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXL15Q9H469 300 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX22C9J3V5 150 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 DLL1O00548 723 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINT2O43291 252 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2H2O95918 312 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 AVPP01185 164 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GPX1P07203 203 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6KQ17RY6 165 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZQT7 251 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.66□□□□□ -1.5
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