RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CGB1A6NKQ9 187 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RRHO14718 337 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RP2O75695 350 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PPYP01298 95 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR9G9P0C7N8 305 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SPP1P10451 314 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CLINT1Q14677 625 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ETV3LQ6ZN32 361 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR10P1Q8NGE3 313 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CFHR4Q92496 578 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 CXorf58Q96LI9 332 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-GP17693 338 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 PAX8Q06710 450 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM86BQ8N661 226 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf92Q96LL3 132 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PRR25Q96S07 402 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GFI1Q99684 422 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 LINC01619G3V211 115 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 HPRT1P00492 218 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CD28P10747 220 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NPY1RP25929 384 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 NAGKQ9UJ70 344 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.6□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A22PA8MWA6 464 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A12PA8MX19 464 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A15PP0C7V4 464 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZSV7 163 aa3.59□□□□□ -1.83
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PTPRC-201ENST00000348564 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR52I2Q8NH67 350 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01006Q8NI28 216 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GPX8Q8TED1 209 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SPSB4Q96A44 273 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.59□□□□□ -1.83
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