RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 LIPFP07098 398 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TCTAP57738 103 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT3O95989 172 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL3SP0C7P2 107 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRFS1P47985 274 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GTI1 187 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RNF222A6NCQ9 220 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM23BQ5SRD1 257 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ARF6P62330 175 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RRHO14718 337 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TFPI2P48307 235 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 GFRA1P56159 465 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 FAM106AQ4KMX7 169 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NEU1Q99519 415 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 FBLN5Q9UBX5 448 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-19P01714 112 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 GRIFINA4D1Z8 144 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 REG1AP05451 166 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 HBBP68871 147 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL5Q9NYP7 299 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 AUP1Q9Y679 476 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 PARP14Q460N5 1801 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 SRP19P09132 144 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 SP9P0CG40 484 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS3P57727 454 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNRF1Q8ND25 227 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 B9A039 149 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 SOD3P08294 240 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf54Q5BKX5 351 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 LOC105371242A0A075B767 164 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 CGB1A6NKQ9 187 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 DDB2Q92466 427 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 PMCHL2Q9BQD1 86 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 LNP1A1A4G5 178 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RPL39P5Q59GN2 51 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 FADS6Q8N9I5 356 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ARL17AQ8IVW1 177 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TEX29Q8N6K0 151 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 IFI27L2Q9H2X8 130 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TM4SF5O14894 197 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 EGR1P18146 543 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 PLP1P60201 277 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF318Q5VUA4 2279 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 RELQ04864 619 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00305Q7Z4B0 112 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H4GQ99525 98 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 CBLN1P23435 193 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NPPCP23582 126 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5G2Q06055 141 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 DNLZQ5SXM8 178 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WWC5 75 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NRXN2Q9P2S2 1712 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 NR2C2APQ86WQ0 139 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 IL4P05112 153 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 PNKDQ8N490 385 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 CBLN4Q9NTU7 201 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 SGK494Q96LW2 274 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 H3BTX0 84 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 HERPUD1Q15011 391 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 IL36BQ9NZH7 164 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF883P0CG24 379 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RNFT1Q5M7Z0 435 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 REC114Q7Z4M0 266 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.6 ms