RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 GFRA1P56159 465 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CLDN18P56856 261 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 AESQ08117 197 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 FA2HQ7L5A8 372 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR4S2Q8NH73 311 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PMCHL1Q16048 86 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 MIC13Q5XKP0 118 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF524Q96C55 264 aa9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 J3QR89 54 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 K7ERU9 68 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 GGNQ86UU5 652 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF716A6NP11 495 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 WISP1O95388 367 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 HLA-DQA1P01909 254 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 GNB2P62879 340 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 DNLZQ5SXM8 178 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SSX8Q7RTT4 187 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 MMD2Q8IY49 270 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IMMP2LQ96T52 175 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PROK2Q9HC23 129 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IL36GQ9NZH8 169 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2H2O95918 312 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CTSSP25774 331 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 DRAM1Q8N682 238 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 RNF2Q99496 336 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 HES4Q9HCC6 221 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.76□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 GZMBP10144 247 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IL3RAP26951 378 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PINLYPA6NC86 204 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC30A6NM36 301 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SRIP30626 198 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 WNT5AP41221 380 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 VSIRQ9H7M9 311 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SYNGR3O43761 229 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 HTR1DP28221 377 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ATOH7Q8N100 152 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRC29Q8WV35 223 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2V2Q96R30 315 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 FZR1Q9UM11 496 aa9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CSN3P07498 182 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CELA3AP09093 270 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 KIR2DS2P43631 304 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 NHLH1Q02575 133 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 EML5Q05BV3 1969 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 S1PR2O95136 353 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 HBZP02008 142 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OPRK1P41145 380 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 OR1L1Q8NH94 360 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 J3QW42 95 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 GZMHP20718 246 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 RAB29O14966 203 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 CLDN14O95500 239 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM87AP0C7U9 286 aa9.74□□□□□ -0.85
CLSTN3-201ENST00000266546 GNG10P50151 68 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms