RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 VPS25Q9BRG1 176 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HES4Q9HCC6 221 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RFNGQ9Y644 331 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CBY3A6NI87 242 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 M0R143 59 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-39P01597 117 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1D-39P04432 117 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR5G3P0C626 314 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 VWA1Q6PCB0 445 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 STPG3Q8N7X2 389 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C15orf61A6NNL5 157 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SELENOTP62341 195 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR4A5Q8NH83 315 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SRRM5B3KS81 715 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PSPNO60542 156 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PRRX1P54821 245 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ARL16Q0P5N6 197 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 DTX1Q86Y01 620 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR5B3Q8NH48 314 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IL36BQ9NZH7 164 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RNF24Q9Y225 148 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FNDC10F2Z333 226 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3-15P01624 115 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HARBI1Q96MB7 349 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 NAGKQ9UJ70 344 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 STUMQ69YW2 141 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR9G9P0C7N8 305 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 BMP5P22003 454 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FOXL1Q12952 345 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PERPQ96FX8 193 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 COQ2Q96H96 371 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF714Q96N38 554 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CA2P00918 260 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MC5RP33032 325 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR4A47Q6IF82 309 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CD55P08174 381 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 STAG3L2P0CL84 134 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 STAG3L3P0CL85 134 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C8orf88P0DMB2 117 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 H0Y8G0 127 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 C16orf97H3BN30 126 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 F2RL2O00254 374 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-13P01766 116 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-7P01780 117 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 FOXF2Q12947 444 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ZNF726P1Q15940 193 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 WDR86Q86TI4 376 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 CCL13Q99616 98 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 SNURFLB1AK76 121 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 PPIAL4DF5H284 164 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS2O15393 492 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DQA1P01909 254 aa7.36□□□□□ -1.23
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