RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 IL36BQ9NZH7 164 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 PEMTQ9UBM1 199 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 LCTP09848 1927 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 MIC13Q5XKP0 118 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 RAB37Q96AX2 223 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 PRR19A6NJB7 356 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 UNC119Q13432 240 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 TCF23Q7RTU1 214 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 TIMP3P35625 211 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.65□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ZG16O60844 167 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NPIPB7O75200 414 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 HLA-DRB1P01911 266 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TCL1AP56279 114 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5LO75964 103 aa7.65□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.65□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 NUP37Q8NFH4 326 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZS49 121 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 E9PLN8 166 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 F8VVB4 439 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 H2BFSP57053 126 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TGIF1Q15583 401 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A28Q96A46 364 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 C17orf100A8MU93 164 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 C12orf77C9JDV5 145 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 LEPROTL1O95214 131 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TBX15Q96SF7 602 aa7.64□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 VWCEQ96DN2 955 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF250P15622 560 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 DUX5Q96PT3 197 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 KCNS1Q96KK3 526 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 TP53RKQ96S44 253 aa7.63□□□□□ -1.19
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 K7ERU9 68 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ASIPP42127 132 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ARPC1AQ92747 370 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 C15orf61A6NNL5 157 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 M0R3E3 92 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA45Q537H7 98 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 RASL11AQ6T310 242 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PNKDQ8N490 385 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 AICDAQ9GZX7 198 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRFP10586 1907 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 A8MXK9 166 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 CSN3P07498 182 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 REG1BP48304 166 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-201ENST00000261266 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.62□□□□□ -1.19
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