RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF491Q8N8L2 437 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR51H1Q8NH63 302 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SORL1Q92673 2214 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL18Q14116 193 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POC5Q8NA72 575 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBE2E2Q96LR5 201 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHB2Q99623 299 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VSIG4Q9Y279 399 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 M0QYG6 137 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR31O00270 319 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACTL6BO94805 426 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HRASP01112 189 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IFNA6P05013 189 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMD2Q8IY49 270 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MCFD2Q8NI22 146 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM68Q96MH6 324 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GNB4Q9HAV0 340 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GABARAPH6UMI1 98 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KBTBD11O94819 623 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR2A4O95047 310 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HPRT1P00492 218 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CD3DP04234 171 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RLN1P04808 185 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SSX9Q7RTT3 188 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR5T1Q8NG75 326 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RHOVQ96L33 236 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MS4A10Q96PG2 267 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR5B12Q96R08 314 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR2A7Q96R45 310 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZMAT4Q9H898 229 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MSGN1A6NI15 193 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TBPP20226 339 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 S100GP29377 79 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAS2R19P59542 299 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CITED4Q96RK1 184 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNCP24821 2201 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTDSPLO15194 276 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRGV3P03979 118 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 APELAP0DMC3 54 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UCP3P55916 312 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TPPP2P59282 170 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAS2R31P59538 309 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR11H1Q8NG94 326 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 H3BUA1 57 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 I3L521 148 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MPPED1O15442 326 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NQO2P16083 231 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 F2RP25116 425 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNFSF8P32971 234 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RUNX1Q01196 453 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPIN2AQ99865 258 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HRASLSQ9HDD0 168 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms