RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trappc6bQ9D289 158 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Timm50Q9D880 353 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 1700013G24RikQ9DAC6 286 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cpn2Q9DBB9 547 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mmp1bQ9EPL6 463 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lime1Q9EQR5 269 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fbp1Q9QXD6 338 aa6.12□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trbv20A0A0B4J1H5 111 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm13762A2ATG2 311 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm436B1AVU6 407 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl3lE9PWZ3 407 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1348F6VB59 318 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krtap24-1G3X9A2 248 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r67G5E8C1 305 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm21761J3QK00 171 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1329L7MTV4 313 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr203L7N205 307 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm6614M0QWR8 670 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Matn3O35701 481 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm20767O70517 169 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Galr2O88854 371 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MbpP04370 250 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 RcvrnP34057 202 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DckP43346 260 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PitpnbP53811 271 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rps25P62852 125 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pdlim4P70271 330 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ShbgP97497 403 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r236Q05A06 334 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc30Q3UV48 300 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spem1Q5F289 310 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr331Q5NC44 324 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lhfpl4Q5U4E0 247 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr198Q7TS40 306 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 IfnkQ7TSL0 199 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zmat4Q8BZ94 229 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc35e4Q8K3D6 351 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rcc1Q8VE37 421 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr447Q8VGP6 310 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rassf1Q99MK9 340 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vgll1Q99NC0 307 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rpl14Q9CR57 217 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4933407L21RikQ9D476 131 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Clvs1Q9D4C9 354 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 2200002D01RikQ9D809 114 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Q9DAE8 263 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem27Q9ESG4 222 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tbl1xQ9QXE7 527 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cited4Q9WUL8 182 aa6.11□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp383A0A087WRR7 490 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scgb2b3D2XZ38 112 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm8973D3YX71 104 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr248E9Q1L6 309 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr568E9Q554 313 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr172E9Q8F6 309 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cited2O35740 269 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 UbcP0CG50 734 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 HfeP70387 359 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm9733Q1AN91 178 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MidnQ3TPJ7 465 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc52Q5M8M9 314 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Foxf1Q61080 378 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fxyd3Q61835 88 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tgfbr2Q62312 592 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Orm3Q63805 206 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scgb1c1Q7M742 95 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tas2r3Q7TQA7 316 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1212Q7TR08 311 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mgat4aQ812G0 535 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mob3cQ8BJG4 216 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cdhr3Q8BL00 831 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Acp6Q8BP40 418 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Inpp5kQ8C5L6 468 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Swi5Q8K3D3 89 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cd226Q8K4F0 333 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr281Q8VET6 311 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1408Q8VG32 310 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Itfg2Q91WI7 443 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Galnt11Q921L8 608 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 8030423J24RikQ9CX45 142 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dimt1Q9D0D4 313 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rnase10Q9D5A9 208 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam122cQ9D5J5 180 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hspb11Q9D6H2 143 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr943Q9EQ92 314 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bpnt1Q9Z0S1 308 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr122W4VSP0 330 aa6.1□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm21854A0A087WNM4 232 aa6.09□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igkv4-50A0A0B4J1J0 117 aa6.09□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa6.09□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CtcflA2APF3 636 aa6.09□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sult2a3D3Z1W5 285 aa6.09□□□□□ -1.43
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm4884E9PVP9 694 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms