RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 PMCHL2Q9BQD1 86 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 CLEC1BQ9P126 229 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 YPEL1O60688 119 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 RAMP3O60896 148 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 CLDN14O95500 239 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 PRRX1P54821 245 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 SRYQ05066 204 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 YPEL2Q96QA6 119 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 HIST3H3Q16695 136 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 RFESDQ8TAC1 157 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 IL36GQ9NZH8 169 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 COL8A2P25067 703 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 OR52L2PQ8NGH6 319 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 GAGE12BA1L429 117 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 SAP30O75446 220 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CRYBB3P26998 211 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CD1BP29016 333 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MFAP2P55001 183 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MUC21Q5SSG8 566 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FOXB1Q99853 325 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 GAGE10A6NGK3 116 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 LINC00205P59089 165 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 HELTA6NFD8 242 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MT-CO2P00403 227 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 IGLL1P15814 213 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 RHBDD2Q6NTF9 364 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 WDR73Q6P4I2 378 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 STPG3Q8N7X2 389 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 ABHD3Q8WU67 409 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 hDV102S1A0JD36 115 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 K7EP13 123 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CXCL13O43927 109 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TNFRSF4P43489 277 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 COMPP49747 757 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PPOXP50336 477 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 DRAM1Q8N682 238 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FGFBP3Q8TAT2 258 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CHRDL1Q9BU40 450 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TRIOO75962 3097 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 GNG7O60262 68 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FAM27BQ5VT28 67 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CSTL1Q9H114 145 aa13□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 MLNRO43193 412 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CTSSP25774 331 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FGF12P61328 243 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CATR1Q13166 79 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CENPWQ5EE01 88 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TIMM9Q9Y5J7 89 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 DNAJC13O75165 2243 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CIDEAO60543 219 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 LTBRP36941 435 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 UBE2G1P62253 170 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PSG5Q15238 335 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 SSX8Q7RTT4 187 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 NABP1Q96AH0 204 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 RAB37Q96AX2 223 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 OR10J4P0C629 311 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TNXAQ16473 311 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PCDH15Q96QU1 1955 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 OR4C46A6NHA9 309 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 GABRG2P18507 467 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 TSKUQ8WUA8 353 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PPIAL4DF5H284 164 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 CSN3P07498 182 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 PLXDC1Q8IUK5 500 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4C-211ENST00000597360 OR5B3Q8NH48 314 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms