RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590599.1

CTDP1-205, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 1,762 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-205ENST00000590599 SSX9Q7RTT3 188 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RPEQ96AT9 228 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RNF222A6NCQ9 220 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TXNL1O43396 289 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 KCNAB3O43448 404 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 SSSCA1O60232 199 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 HRASP01112 189 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ID3Q02535 119 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OPCMLQ14982 345 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 IGKV1-16P04430 117 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 HTR1DP28221 377 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RAB13P51153 203 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 MIDNQ504T8 468 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 HCP5Q6MZN7 132 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 PDPNQ86YL7 162 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 GON7Q9BXV9 100 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TMEM140Q9NV12 185 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ODF3BA8MYP8 253 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 CEACAM3P40198 252 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 VAMP2P63027 116 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RHOVQ96L33 236 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 AQP10Q96PS8 301 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 LEUTXA8MZ59 168 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 MMP9P14780 707 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 MC5RP33032 325 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ARHGDIBP52566 201 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 LHX4Q969G2 390 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 DPM3Q9P2X0 92 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 ZANQ9Y493 2812 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 MSGN1A6NI15 193 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 SHOXO15266 292 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR9G9P0C7N8 305 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 P2RY1P47900 373 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 IFITM2Q01629 132 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 OR4A16Q8NH70 328 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 HARBI1Q96MB7 349 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 TBX15Q96SF7 602 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-205ENST00000590599 LY6LH3BQJ8 138 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 HKR1P10072 659 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 POU2AF1Q16633 256 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 TMEM177Q53S58 311 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 OR4A47Q6IF82 309 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 MOB3BQ86TA1 216 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 MBD6Q96DN6 1003 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 FOXC2Q99958 501 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 A0A1W2PRD5 423 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 A0A1W2PRF3 423 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 A0A1W2PRM7 423 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 BCL2L11O43521 198 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 SYNGR2O43760 224 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 CHST1O43916 411 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 OR2B8PP59922 312 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 TNFRSF9Q07011 255 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 Q5PR19 223 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 WFDC11Q8NEX6 87 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 RAB40CQ96S21 281 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 MED6O75586 246 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 MSMBP08118 114 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 CAV2P51636 162 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 LGALS4P56470 323 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 MTORP42345 2549 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 B4DSR2 109 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 GPR137BO60478 399 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 UBE2E1P51965 193 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-205ENST00000590599 UBE2KP61086 200 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms