RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	CORO2A	Q92828	525 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TVP23C	Q96ET8	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	YPEL2	Q96QA6	119 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	VAX2	Q9UIW0	290 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SMCO3	A2RU48	225 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM250	H0YL14	139 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	LYZL6	O75951	148 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CST7	O76096	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2C1	O95371	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HPRT1	P00492	218 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HBZ	P02008	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYBA1	P05813	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB5A	P20339	215 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MPV17	P39210	176 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR12	P47775	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRA2	P47869	451 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NPBWR1	P48145	328 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMB3	P49720	205 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FABP6	P51161	128 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	PAX9	P55771	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SPCS3	P61009	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ERVK-16	P61578	105 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB11A	P62491	216 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	AARD	Q4LEZ3	155 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR82	Q6UXN9	313 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZTC4	211 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NANP	Q8TBE9	248 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB39B	Q96DA2	213 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	STARD4	Q96DR4	205 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	C14orf79	Q96F83	325 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF488	Q96MN9	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ARID1A	O14497	2285 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM186A	A6NE01	2351 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1W2PR80	420 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	ODAM	A1E959	279 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NNC1	897 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SRRM5	B3KS81	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf77	C9JDV5	145 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	FNDC10	F2Z333	226 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289		H3BQ15	152 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	RHOD	O00212	210 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFSF12	O43508	249 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM50A	O95807	157 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	HRAS	P01112	189 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	KRAS	P01116	189 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CGA	P01215	116 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	CECR9	P0C854	216 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	BCL2	P10415	239 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	IRF2	P14316	349 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	NQO2	P16083	231 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	AGA	P20933	346 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	OR3A1	P47881	315 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PTPRM-215	ENST00000583289	GLIPR1	P48060	266 aa		3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms