RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OR5H14A6NHG9 310 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 M0R1X1 148 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RAB27BO00194 218 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ITGB1BP1O14713 200 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CTDSPLO15194 276 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM127O75204 238 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ELANEP08246 267 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR3AP08637 254 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR8U9P0C7N5 309 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ELK1P19419 428 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 BTCP35070 178 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MYCNOSP40205 109 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FOXE3Q13461 319 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 DYRK1AQ13627 763 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CDNFQ49AH0 187 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IGSF11Q5DX21 431 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR8U1Q8NH10 309 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PTX4Q96A99 478 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 DUX3Q96PT4 197 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CLCC1Q96S66 551 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 AGMATQ9BSE5 352 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FBXL15Q9H469 300 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 H0YJW9 148 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SMLR1H3BR10 107 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 I3L521 148 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 CCL24O00175 119 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MFNGO00587 321 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RRHO14718 337 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V0E1O15342 81 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PRAF2O60831 178 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RBBP9O75884 186 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SCGNO76038 276 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 APOA2P02652 100 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBP04435 133 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IGF1P05019 195 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ZP3P21754 424 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 THBS3P49746 956 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 PITPNAQ00169 270 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 ECSCRQ19T08 205 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 IDNKQ5T6J7 187 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 REC114Q7Z4M0 266 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 NPBQ8NG41 125 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 MRAPQ8TCY5 172 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 DPF1Q92782 380 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 OR2D2Q9H210 308 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 G3V318 75 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA3O95167 84 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MPC2O95563 127 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 IGHG4P01861 327 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-DRB1P01911 266 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00205P59089 165 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CX3CL1P78423 397 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 DEFB136Q30KP8 78 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF383Q8NA42 475 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 RNF5Q99942 180 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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